Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms