Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms