Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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