Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms