Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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