Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab17P35292 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab17P35292 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab17P35292 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab17P35292 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab17P35292 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab17P35292 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab17P35292 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab17P35292 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab17P35292 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab17P35292 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab17P35292 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab17P35292 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms