Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pola2P33611 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pola2P33611 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms