Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms