Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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