Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms