Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Tnp1P10856 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms