Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TnfP06804 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnfP06804 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnfP06804 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TnfP06804 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TnfP06804 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TnfP06804 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TnfP06804 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TnfP06804 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TnfP06804 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TnfP06804 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TnfP06804 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TnfP06804 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms