Protein–RNA interactions for Protein: O88413

Tulp3, Tubby-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp3O88413 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tulp3O88413 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tulp3O88413 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms