Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Dgcr6O35347 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Dgcr6O35347 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Dgcr6O35347 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Dgcr6O35347 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Dgcr6O35347 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Dgcr6O35347 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dgcr6O35347 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms