Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms