Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3C2AO00443 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms