Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms