Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nccrp1G3X9C2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms