Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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