Protein–RNA interactions for Protein: F6QI24

Gm7945, Predicted gene 7945 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7945F6QI24 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7945F6QI24 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7945F6QI24 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms