Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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