Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Ccdc171E9Q1U1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Ccdc171E9Q1U1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
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Ccdc171E9Q1U1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Ccdc171E9Q1U1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Ccdc171E9Q1U1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Ccdc171E9Q1U1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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Ccdc171E9Q1U1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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