Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms