Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms