RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1
FAM3D, Protein FAM3D, human
Predictions only
Length
224 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.722-201
ENST00000517279
114 nt
BASIC
-2.89
□□□□□ -2.87
FAM3D
Q96BQ1
MIR4662A-201
ENST00000637499
67 nt
BASIC
-2.89
□□□□□ -2.87
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-471P-201
ENST00000383944
106 nt
BASIC
-2.9
□□□□□ -2.87
FAM3D
Q96BQ1
RNY4P25-201
ENST00000459254
96 nt
BASIC
-2.9
□□□□□ -2.87
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-345P-201
ENST00000517001
107 nt
BASIC
-2.9
□□□□□ -2.87
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.421-201
ENST00000384052
101 nt
BASIC
-2.92
□□□□□ -2.88
FAM3D
Q96BQ1
MIR4723-201
ENST00000585070
81 nt
BASIC
-2.94
□□□□□ -2.88
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.43-201
ENST00000362670
111 nt
BASIC
-2.95
□□□□□ -2.88
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-446P-201
ENST00000362827
106 nt
BASIC
-2.95
□□□□□ -2.88
FAM3D
Q96BQ1
MIR1302-4-201
ENST00000408701
150 nt
BASIC
-2.96
□□□□□ -2.88
FAM3D
Q96BQ1
MIRLET7A3-201
ENST00000362116
74 nt
BASIC
-2.97
□□□□□ -2.88
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1312P-201
ENST00000362425
108 nt
BASIC
-2.97
□□□□□ -2.88
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1169P-201
ENST00000363537
103 nt
BASIC
-2.97
□□□□□ -2.88
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.79-201
ENST00000362992
113 nt
BASIC
-2.98
□□□□□ -2.89
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.228-201
ENST00000364346
98 nt
BASIC
-2.99
□□□□□ -2.89
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.403-201
ENST00000383977
101 nt
BASIC
-3
□□□□□ -2.89
FAM3D
Q96BQ1
AC114801.3-201
ENST00000510231
177 nt
BASIC
-3.01
□□□□□ -2.89
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.134-201
ENST00000363435
105 nt
BASIC
-3.02
□□□□□ -2.89
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-822P-201
ENST00000362707
106 nt
BASIC
-3.03
□□□□□ -2.89
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.830-201
ENST00000628531
96 nt
BASIC
-3.03
□□□□□ -2.89
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.612-201
ENST00000410717
95 nt
BASIC
-3.04
□□□□□ -2.9
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.382-201
ENST00000365672
114 nt
BASIC
-3.06
□□□□□ -2.9
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.685-201
ENST00000516532
108 nt
BASIC
-3.07
□□□□□ -2.9
FAM3D
Q96BQ1
AL359920.1-201
ENST00000618332
176 nt
BASIC
-3.07
□□□□□ -2.9
FAM3D
Q96BQ1
MIR4317-201
ENST00000637586
65 nt
BASIC
-3.07
□□□□□ -2.9
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.186-201
ENST00000363899
92 nt
BASIC
-3.08
□□□□□ -2.9
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.266-201
ENST00000364678
96 nt
BASIC
-3.09
□□□□□ -2.9
FAM3D
Q96BQ1
SNORD113-4-201
ENST00000364802
75 nt
BASIC
-3.09
□□□□□ -2.9
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.658-201
ENST00000515990
97 nt
BASIC
-3.09
□□□□□ -2.9
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-737P-201
ENST00000365370
107 nt
BASIC
-3.12
□□□□□ -2.91
FAM3D
Q96BQ1
RNU4-33P-201
ENST00000364316
85 nt
BASIC
-3.13
□□□□□ -2.91
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1044P-201
ENST00000384755
107 nt
BASIC
-3.13
□□□□□ -2.91
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.652-201
ENST00000458902
102 nt
BASIC
-3.13
□□□□□ -2.91
FAM3D
Q96BQ1
AC139453.2-201
ENST00000487255
133 nt
BASIC
-3.13
□□□□□ -2.91
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.663-201
ENST00000516043
101 nt
BASIC
-3.14
□□□□□ -2.91
FAM3D
Q96BQ1
MIR548H4-201
ENST00000408689
111 nt
BASIC
-3.15
□□□□□ -2.91
FAM3D
Q96BQ1
MIR548AL-201
ENST00000578416
97 nt
BASIC
-3.15
□□□□□ -2.91
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-803P-201
ENST00000516034
102 nt
BASIC
-3.16
□□□□□ -2.92
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-829P-201
ENST00000363700
112 nt
BASIC
-3.17
□□□□□ -2.92
FAM3D
Q96BQ1
SNORD114-13-201
ENST00000364377
74 nt
BASIC
-3.18
□□□□□ -2.92
FAM3D
Q96BQ1
RNY4P7-201
ENST00000364600
96 nt
BASIC
-3.18
□□□□□ -2.92
FAM3D
Q96BQ1
MIR633-201
ENST00000384821
98 nt
BASIC
-3.19
□□□□□ -2.92
FAM3D
Q96BQ1
MIR656-201
ENST00000385224
78 nt
BASIC
-3.21
□□□□□ -2.92
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1275P-201
ENST00000391087
107 nt
BASIC
-3.21
□□□□□ -2.92
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.206-201
ENST00000364136
102 nt
BASIC
-3.22
□□□□□ -2.92
FAM3D
Q96BQ1
RNA5SP224-201
ENST00000365069
126 nt
BASIC
-3.22
□□□□□ -2.92
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-854P-201
ENST00000364036
107 nt
BASIC
-3.23
□□□□□ -2.93
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.260-201
ENST00000364628
101 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
FAM3D
Q96BQ1
MIR509-1-201
ENST00000385265
94 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
FAM3D
Q96BQ1
MIR509-2-201
ENST00000390724
91 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
FAM3D
Q96BQ1
SNORD45C-201
ENST00000383893
79 nt
BASIC
-3.27
□□□□□ -2.93
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1204P-201
ENST00000363948
107 nt
BASIC
-3.29
□□□□□ -2.94
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1340P-201
ENST00000384438
107 nt
BASIC
-3.29
□□□□□ -2.94
FAM3D
Q96BQ1
SNORD115.2-201
ENST00000391126
59 nt
BASIC
-3.29
□□□□□ -2.94
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1326P-201
ENST00000391262
107 nt
BASIC
-3.29
□□□□□ -2.94
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-836P-201
ENST00000362920
107 nt
BASIC
-3.31
□□□□□ -2.94
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.511-201
ENST00000384514
103 nt
BASIC
-3.31
□□□□□ -2.94
FAM3D
Q96BQ1
SNORD115-45-201
ENST00000391078
81 nt
BASIC
-3.31
□□□□□ -2.94
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1161P-201
ENST00000516176
102 nt
BASIC
-3.31
□□□□□ -2.94
FAM3D
Q96BQ1
RNY4-201
ENST00000516507
96 nt
BASIC
-3.31
□□□□□ -2.94
FAM3D
Q96BQ1
AC079150.2-201
ENST00000443733
78 nt
BASIC
-3.33
□□□□□ -2.94
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-808P-201
ENST00000391233
108 nt
BASIC
-3.34
□□□□□ -2.94
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.204-201
ENST00000364112
102 nt
BASIC
-3.35
□□□□□ -2.95
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.137-201
ENST00000363455
112 nt
BASIC
-3.36
□□□□□ -2.95
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.345-201
ENST00000365384
92 nt
BASIC
-3.36
□□□□□ -2.95
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1008P-201
ENST00000384160
104 nt
BASIC
-3.36
□□□□□ -2.95
FAM3D
Q96BQ1
MIR124-1-201
ENST00000385275
85 nt
BASIC
-3.37
□□□□□ -2.95
FAM3D
Q96BQ1
AC125388.1-201
ENST00000459631
156 nt
BASIC
-3.37
□□□□□ -2.95
FAM3D
Q96BQ1
RNA5SP106-201
ENST00000517274
100 nt
BASIC
-3.37
□□□□□ -2.95
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-838P-201
ENST00000363399
108 nt
BASIC
-3.39
□□□□□ -2.95
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.335-201
ENST00000365299
96 nt
BASIC
-3.39
□□□□□ -2.95
FAM3D
Q96BQ1
TRAJ42-201
ENST00000390495
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-3.39
□□□□□ -2.95
FAM3D
Q96BQ1
RNY4P10-201
ENST00000365571
96 nt
BASIC
-3.4
□□□□□ -2.95
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-987P-201
ENST00000384759
104 nt
BASIC
-3.4
□□□□□ -2.95
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.379-201
ENST00000365653
102 nt
BASIC
-3.41
□□□□□ -2.96
FAM3D
Q96BQ1
MIR548AH-201
ENST00000637109
76 nt
BASIC
-3.42
□□□□□ -2.96
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.657-201
ENST00000515983
102 nt
BASIC
-3.43
□□□□□ -2.96
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.566-201
ENST00000384735
101 nt
BASIC
-3.45
□□□□□ -2.96
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-788P-201
ENST00000390967
104 nt
BASIC
-3.46
□□□□□ -2.96
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1121P-201
ENST00000516802
109 nt
BASIC
-3.46
□□□□□ -2.96
FAM3D
Q96BQ1
hsa-mir-550a-2.1-201
ENST00000637473
97 nt
BASIC
-3.47
□□□□□ -2.96
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-499P-201
ENST00000365615
107 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-638P-201
ENST00000516582
104 nt
BASIC
-3.53
□□□□□ -2.97
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-753P-201
ENST00000363926
107 nt
BASIC
-3.55
□□□□□ -2.98
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-422P-201
ENST00000384632
107 nt
BASIC
-3.55
□□□□□ -2.98
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-59P-201
ENST00000384787
107 nt
BASIC
-3.55
□□□□□ -2.98
FAM3D
Q96BQ1
MIR545-201
ENST00000385085
106 nt
BASIC
-3.55
□□□□□ -2.98
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-986P-201
ENST00000363133
102 nt
BASIC
-3.56
□□□□□ -2.98
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-936P-201
ENST00000384005
107 nt
BASIC
-3.6
□□□□□ -2.99
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-665P-201
ENST00000384639
107 nt
BASIC
-3.61
□□□□□ -2.99
FAM3D
Q96BQ1
SNORA72.7-201
ENST00000516349
94 nt
BASIC
-3.63
□□□□□ -2.99
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-930P-201
ENST00000390938
100 nt
BASIC
-3.65
□□□□□ -2.99
FAM3D
Q96BQ1
MIR548F3-201
ENST00000408509
87 nt
BASIC
-3.66
□□□□□ -3
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1043P-201
ENST00000410355
99 nt
BASIC
-3.73
□□□□□ -3.01
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-614P-201
ENST00000384369
107 nt
BASIC
-3.8
□□□□□ -3.02
FAM3D
Q96BQ1
U6.59-201
ENST00000615686
107 nt
BASIC
-3.8
□□□□□ -3.02
FAM3D
Q96BQ1
SOX2OT_exon4.1-201
ENST00000610449
109 nt
BASIC
-3.83
□□□□□ -3.02
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.406-201
ENST00000383984
100 nt
BASIC
-3.87
□□□□□ -3.03
FAM3D
Q96BQ1
DLEU2_4.2-201
ENST00000616613
58 nt
BASIC
-3.91
□□□□□ -3.04
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.520-201
ENST00000384556
102 nt
BASIC
-3.93
□□□□□ -3.04
First
Previous
985
Next
Last
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.9 ms