Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
RAB40BQ12829 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
RAB40BQ12829 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
RAB40BQ12829 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
RAB40BQ12829 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
RAB40BQ12829 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
RAB40BQ12829 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
RAB40BQ12829 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
RAB40BQ12829 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
RAB40BQ12829 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
RAB40BQ12829 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
RAB40BQ12829 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
RAB40BQ12829 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
RAB40BQ12829 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
RAB40BQ12829 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
RAB40BQ12829 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
RAB40BQ12829 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
RAB40BQ12829 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
RAB40BQ12829 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
RAB40BQ12829 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RAB40BQ12829 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RAB40BQ12829 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RAB40BQ12829 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RAB40BQ12829 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RAB40BQ12829 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
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RAB40BQ12829 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
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RAB40BQ12829 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
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RAB40BQ12829 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
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RAB40BQ12829 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
RAB40BQ12829 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
RAB40BQ12829 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
RAB40BQ12829 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
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RAB40BQ12829 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
RAB40BQ12829 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
RAB40BQ12829 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
RAB40BQ12829 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
RAB40BQ12829 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
RAB40BQ12829 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
RAB40BQ12829 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
RAB40BQ12829 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
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RAB40BQ12829 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
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RAB40BQ12829 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
RAB40BQ12829 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
RAB40BQ12829 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
RAB40BQ12829 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
RAB40BQ12829 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
RAB40BQ12829 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
RAB40BQ12829 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.78□□□□□ -2.85
RAB40BQ12829 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
RAB40BQ12829 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
RAB40BQ12829 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
RAB40BQ12829 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
RAB40BQ12829 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
RAB40BQ12829 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
RAB40BQ12829 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
RAB40BQ12829 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
RAB40BQ12829 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
RAB40BQ12829 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
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