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Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9
TMOD3, Tropomodulin-3, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
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Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
TMOD3
Q9NYL9
RNU7-119P-201
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TMOD3
Q9NYL9
MIR4679-1-201
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BASIC
-2.14
□□□□□ -2.75
TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.103-201
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BASIC
-2.15
□□□□□ -2.75
TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.449-201
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102 nt
BASIC
-2.15
□□□□□ -2.75
TMOD3
Q9NYL9
RNU6-800P-201
ENST00000384473
103 nt
BASIC
-2.15
□□□□□ -2.75
TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.565-201
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BASIC
-2.15
□□□□□ -2.75
TMOD3
Q9NYL9
RNU6-776P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.76
TMOD3
Q9NYL9
RNU6-1022P-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.76
TMOD3
Q9NYL9
RNU6-841P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.76
TMOD3
Q9NYL9
MIR487B-201
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BASIC
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□□□□□ -2.76
TMOD3
Q9NYL9
RNU6-1034P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.76
TMOD3
Q9NYL9
MIR3938-201
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BASIC
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□□□□□ -2.76
TMOD3
Q9NYL9
U6.97-201
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BASIC
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□□□□□ -2.76
TMOD3
Q9NYL9
MIR4662A-201
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BASIC
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□□□□□ -2.76
TMOD3
Q9NYL9
AC110620.1-201
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228 nt
BASIC
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□□□□□ -2.76
TMOD3
Q9NYL9
SNORD54-201
ENST00000459159
67 nt
BASIC
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□□□□□ -2.76
TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.386-201
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
TRGJP-201
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APPRIS P1
BASIC
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□□□□□ -2.76
TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.685-201
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108 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
TMOD3
Q9NYL9
MIR466-201
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
RNU6-361P-201
ENST00000364454
107 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
TMOD3
Q9NYL9
SNORD19B.1-201
ENST00000630615
80 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
TMOD3
Q9NYL9
RNA5SP93-201
ENST00000362525
114 nt
BASIC
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□□□□□ -2.77
TMOD3
Q9NYL9
MIR581-201
ENST00000384895
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BASIC
-2.24
□□□□□ -2.77
TMOD3
Q9NYL9
MIR548N-201
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75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.77
TMOD3
Q9NYL9
SNORD18C-201
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69 nt
BASIC
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□□□□□ -2.77
TMOD3
Q9NYL9
AL451105.1-201
ENST00000450005
189 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
TMOD3
Q9NYL9
MIR548AM-201
ENST00000584298
74 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
TMOD3
Q9NYL9
MIR202-201
ENST00000362219
110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.77
TMOD3
Q9NYL9
SNORD60-201
ENST00000383903
83 nt
BASIC
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□□□□□ -2.77
TMOD3
Q9NYL9
RNY4-201
ENST00000516507
96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.77
TMOD3
Q9NYL9
RNU6-118P-201
ENST00000516552
102 nt
BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
TMOD3
Q9NYL9
SNORA17.4-201
ENST00000391287
132 nt
BASIC
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□□□□□ -2.78
TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.223-201
ENST00000364290
113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.78
TMOD3
Q9NYL9
RNU6-419P-201
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
RNU6-471P-201
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
RNU6-1275P-201
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
RNU6-530P-201
ENST00000391180
107 nt
BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.53-201
ENST00000362765
102 nt
BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.421-201
ENST00000384052
101 nt
BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
SNORD45.2-201
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BASIC
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Q9NYL9
SNORD18.1-201
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TMOD3
Q9NYL9
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BASIC
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Q9NYL9
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
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BASIC
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Q9NYL9
MIR548W-201
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Q9NYL9
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snoU13.10-201
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TMOD3
Q9NYL9
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BASIC
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Q9NYL9
RNU6-1079P-201
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
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TMOD3
Q9NYL9
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Q9NYL9
MIR4756-201
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TMOD3
Q9NYL9
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BASIC
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Q9NYL9
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Q9NYL9
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Q9NYL9
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
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TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.349-201
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Q9NYL9
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Q9NYL9
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
CR2-207
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TSL 1 (best)
BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
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TMOD3
Q9NYL9
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TMOD3
Q9NYL9
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.591-201
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
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Q9NYL9
SNORD113-4-201
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TMOD3
Q9NYL9
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TMOD3
Q9NYL9
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.284-201
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102 nt
BASIC
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Q9NYL9
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
SNORA72.7-201
ENST00000516349
94 nt
BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
ZEB2_AS1_4.1-201
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.211-201
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BASIC
-2.65
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TMOD3
Q9NYL9
RNU6-638P-201
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104 nt
BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
LINC01984-201
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301 nt
TSL 3
BASIC
-2.65
□□□□□ -2.83
TMOD3
Q9NYL9
RNU6-829P-201
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.320-201
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BASIC
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□□□□□ -2.84
TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.647-201
ENST00000459194
112 nt
BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.640-201
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112 nt
BASIC
-2.66
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TMOD3
Q9NYL9
Y_RNA.803-201
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BASIC
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Q9NYL9
Y_RNA.815-201
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
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BASIC
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Q9NYL9
Y_RNA.827-201
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
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BASIC
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Q9NYL9
FTX_4.1-201
ENST00000616291
147 nt
BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
MIR4748-201
ENST00000578076
82 nt
BASIC
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□□□□□ -2.84
TMOD3
Q9NYL9
MIR633-201
ENST00000384821
98 nt
BASIC
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Q9NYL9
MT-TM-201
ENST00000387377
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BASIC
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TMOD3
Q9NYL9
RNA5SP405-201
ENST00000363059
114 nt
BASIC
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□□□□□ -2.85
TMOD3
Q9NYL9
RNU4-33P-201
ENST00000364316
85 nt
BASIC
-2.74
□□□□□ -2.85
TMOD3
Q9NYL9
TRAJ42-201
ENST00000390495
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-2.74
□□□□□ -2.85
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