Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CCDC47Q96A33 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CCDC47Q96A33 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CCDC47Q96A33 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CCDC47Q96A33 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CCDC47Q96A33 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CCDC47Q96A33 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-3.16□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.19□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
CCDC47Q96A33 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CCDC47Q96A33 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CCDC47Q96A33 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
CCDC47Q96A33 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CCDC47Q96A33 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CCDC47Q96A33 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CCDC47Q96A33 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CCDC47Q96A33 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CCDC47Q96A33 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CCDC47Q96A33 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CCDC47Q96A33 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CCDC47Q96A33 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CCDC47Q96A33 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CCDC47Q96A33 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CCDC47Q96A33 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CCDC47Q96A33 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.31□□□□□ -2.94
CCDC47Q96A33 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CCDC47Q96A33 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CCDC47Q96A33 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CCDC47Q96A33 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
CCDC47Q96A33 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
CCDC47Q96A33 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
CCDC47Q96A33 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
CCDC47Q96A33 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
CCDC47Q96A33 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
CCDC47Q96A33 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
CCDC47Q96A33 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
CCDC47Q96A33 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
CCDC47Q96A33 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
CCDC47Q96A33 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
CCDC47Q96A33 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
CCDC47Q96A33 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
CCDC47Q96A33 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
CCDC47Q96A33 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
CCDC47Q96A33 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
CCDC47Q96A33 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
CCDC47Q96A33 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
CCDC47Q96A33 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
CCDC47Q96A33 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
CCDC47Q96A33 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
CCDC47Q96A33 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
CCDC47Q96A33 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
CCDC47Q96A33 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
CCDC47Q96A33 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
CCDC47Q96A33 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
CCDC47Q96A33 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
CCDC47Q96A33 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
CCDC47Q96A33 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
CCDC47Q96A33 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CCDC47Q96A33 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CCDC47Q96A33 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
CCDC47Q96A33 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
CCDC47Q96A33 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
CCDC47Q96A33 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
CCDC47Q96A33 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
CCDC47Q96A33 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
CCDC47Q96A33 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
CCDC47Q96A33 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
CCDC47Q96A33 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CCDC47Q96A33 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
CCDC47Q96A33 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.5 ms