Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMARCE1Q969G3 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMARCE1Q969G3 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMARCE1Q969G3 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SMARCE1Q969G3 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SMARCE1Q969G3 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SMARCE1Q969G3 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SMARCE1Q969G3 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SMARCE1Q969G3 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SMARCE1Q969G3 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SMARCE1Q969G3 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SMARCE1Q969G3 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SMARCE1Q969G3 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.13□□□□□ -2.75
SMARCE1Q969G3 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SMARCE1Q969G3 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMARCE1Q969G3 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SMARCE1Q969G3 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SMARCE1Q969G3 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SMARCE1Q969G3 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SMARCE1Q969G3 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SMARCE1Q969G3 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SMARCE1Q969G3 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMARCE1Q969G3 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.25□□□□□ -2.77
SMARCE1Q969G3 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SMARCE1Q969G3 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SMARCE1Q969G3 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SMARCE1Q969G3 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SMARCE1Q969G3 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SMARCE1Q969G3 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SMARCE1Q969G3 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SMARCE1Q969G3 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SMARCE1Q969G3 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SMARCE1Q969G3 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SMARCE1Q969G3 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SMARCE1Q969G3 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SMARCE1Q969G3 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SMARCE1Q969G3 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SMARCE1Q969G3 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.34□□□□□ -2.78
SMARCE1Q969G3 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SMARCE1Q969G3 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SMARCE1Q969G3 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SMARCE1Q969G3 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SMARCE1Q969G3 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SMARCE1Q969G3 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SMARCE1Q969G3 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SMARCE1Q969G3 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SMARCE1Q969G3 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SMARCE1Q969G3 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SMARCE1Q969G3 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SMARCE1Q969G3 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SMARCE1Q969G3 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SMARCE1Q969G3 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SMARCE1Q969G3 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SMARCE1Q969G3 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMARCE1Q969G3 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
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