Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
UBXN4Q92575 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
UBXN4Q92575 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
UBXN4Q92575 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
UBXN4Q92575 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
UBXN4Q92575 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
UBXN4Q92575 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
UBXN4Q92575 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
UBXN4Q92575 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
UBXN4Q92575 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
UBXN4Q92575 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
UBXN4Q92575 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
UBXN4Q92575 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
UBXN4Q92575 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
UBXN4Q92575 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
UBXN4Q92575 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
UBXN4Q92575 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
UBXN4Q92575 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
UBXN4Q92575 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
UBXN4Q92575 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
UBXN4Q92575 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
UBXN4Q92575 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
UBXN4Q92575 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
UBXN4Q92575 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
UBXN4Q92575 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
UBXN4Q92575 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
UBXN4Q92575 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
UBXN4Q92575 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
UBXN4Q92575 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
UBXN4Q92575 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
UBXN4Q92575 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
UBXN4Q92575 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
UBXN4Q92575 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
UBXN4Q92575 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
UBXN4Q92575 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
UBXN4Q92575 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
UBXN4Q92575 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
UBXN4Q92575 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
UBXN4Q92575 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
UBXN4Q92575 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
UBXN4Q92575 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
UBXN4Q92575 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
UBXN4Q92575 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
UBXN4Q92575 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
UBXN4Q92575 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
UBXN4Q92575 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
UBXN4Q92575 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
UBXN4Q92575 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.02□□□□□ -2.73
UBXN4Q92575 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
UBXN4Q92575 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
UBXN4Q92575 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
UBXN4Q92575 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
UBXN4Q92575 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
UBXN4Q92575 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
UBXN4Q92575 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
UBXN4Q92575 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
UBXN4Q92575 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.05□□□□□ -2.74
UBXN4Q92575 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
UBXN4Q92575 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
UBXN4Q92575 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
UBXN4Q92575 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
UBXN4Q92575 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
UBXN4Q92575 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
UBXN4Q92575 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
UBXN4Q92575 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
UBXN4Q92575 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
UBXN4Q92575 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
UBXN4Q92575 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
UBXN4Q92575 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
UBXN4Q92575 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
UBXN4Q92575 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
UBXN4Q92575 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
UBXN4Q92575 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
UBXN4Q92575 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
UBXN4Q92575 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
UBXN4Q92575 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
UBXN4Q92575 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
UBXN4Q92575 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
UBXN4Q92575 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
UBXN4Q92575 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
UBXN4Q92575 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.29□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.34□□□□□ -2.78
UBXN4Q92575 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
UBXN4Q92575 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
UBXN4Q92575 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.2 ms