Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TMEM200BQ69YZ2 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TMEM200BQ69YZ2 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TMEM200BQ69YZ2 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TMEM200BQ69YZ2 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TMEM200BQ69YZ2 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TMEM200BQ69YZ2 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TMEM200BQ69YZ2 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TMEM200BQ69YZ2 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TMEM200BQ69YZ2 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TMEM200BQ69YZ2 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TMEM200BQ69YZ2 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TMEM200BQ69YZ2 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TMEM200BQ69YZ2 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TMEM200BQ69YZ2 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TMEM200BQ69YZ2 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TMEM200BQ69YZ2 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TMEM200BQ69YZ2 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMEM200BQ69YZ2 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMEM200BQ69YZ2 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMEM200BQ69YZ2 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMEM200BQ69YZ2 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMEM200BQ69YZ2 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMEM200BQ69YZ2 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TMEM200BQ69YZ2 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms