Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
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LONRF1Q17RB8 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.11□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
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LONRF1Q17RB8 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
LONRF1Q17RB8 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
LONRF1Q17RB8 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
LONRF1Q17RB8 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
LONRF1Q17RB8 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
LONRF1Q17RB8 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
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