Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRNQ16849 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRNQ16849 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRNQ16849 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRNQ16849 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPRNQ16849 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPRNQ16849 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPRNQ16849 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPRNQ16849 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPRNQ16849 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPRNQ16849 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPRNQ16849 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPRNQ16849 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPRNQ16849 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPRNQ16849 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRNQ16849 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRNQ16849 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRNQ16849 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRNQ16849 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRNQ16849 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRNQ16849 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRNQ16849 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRNQ16849 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRNQ16849 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRNQ16849 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRNQ16849 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRNQ16849 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRNQ16849 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRNQ16849 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRNQ16849 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRNQ16849 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRNQ16849 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRNQ16849 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRNQ16849 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRNQ16849 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRNQ16849 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRNQ16849 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRNQ16849 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRNQ16849 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRNQ16849 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRNQ16849 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRNQ16849 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRNQ16849 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRNQ16849 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRNQ16849 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRNQ16849 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRNQ16849 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRNQ16849 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRNQ16849 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRNQ16849 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRNQ16849 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRNQ16849 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRNQ16849 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRNQ16849 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRNQ16849 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRNQ16849 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRNQ16849 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRNQ16849 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRNQ16849 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRNQ16849 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRNQ16849 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRNQ16849 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRNQ16849 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRNQ16849 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRNQ16849 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRNQ16849 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRNQ16849 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRNQ16849 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRNQ16849 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRNQ16849 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRNQ16849 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRNQ16849 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRNQ16849 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRNQ16849 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRNQ16849 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRNQ16849 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRNQ16849 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRNQ16849 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRNQ16849 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRNQ16849 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRNQ16849 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRNQ16849 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRNQ16849 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRNQ16849 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRNQ16849 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRNQ16849 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.2 ms