Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECM1Q16610 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECM1Q16610 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECM1Q16610 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECM1Q16610 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECM1Q16610 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ECM1Q16610 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ECM1Q16610 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ECM1Q16610 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ECM1Q16610 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ECM1Q16610 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ECM1Q16610 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ECM1Q16610 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ECM1Q16610 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ECM1Q16610 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ECM1Q16610 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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ECM1Q16610 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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ECM1Q16610 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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ECM1Q16610 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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ECM1Q16610 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ECM1Q16610 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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ECM1Q16610 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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ECM1Q16610 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ECM1Q16610 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ECM1Q16610 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ECM1Q16610 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ECM1Q16610 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ECM1Q16610 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ECM1Q16610 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ECM1Q16610 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ECM1Q16610 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ECM1Q16610 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ECM1Q16610 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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