Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ODF1Q14990 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ODF1Q14990 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ODF1Q14990 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ODF1Q14990 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ODF1Q14990 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ODF1Q14990 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ODF1Q14990 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ODF1Q14990 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ODF1Q14990 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ODF1Q14990 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ODF1Q14990 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ODF1Q14990 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ODF1Q14990 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ODF1Q14990 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ODF1Q14990 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ODF1Q14990 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ODF1Q14990 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ODF1Q14990 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ODF1Q14990 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ODF1Q14990 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ODF1Q14990 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ODF1Q14990 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ODF1Q14990 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ODF1Q14990 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ODF1Q14990 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms