Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TNFAIP1Q13829 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TNFAIP1Q13829 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TNFAIP1Q13829 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TNFAIP1Q13829 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TNFAIP1Q13829 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TNFAIP1Q13829 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TNFAIP1Q13829 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TNFAIP1Q13829 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TNFAIP1Q13829 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TNFAIP1Q13829 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TNFAIP1Q13829 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TNFAIP1Q13829 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TNFAIP1Q13829 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TNFAIP1Q13829 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TNFAIP1Q13829 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TNFAIP1Q13829 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TNFAIP1Q13829 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TNFAIP1Q13829 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TNFAIP1Q13829 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TNFAIP1Q13829 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TNFAIP1Q13829 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TNFAIP1Q13829 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TNFAIP1Q13829 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TNFAIP1Q13829 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TNFAIP1Q13829 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TNFAIP1Q13829 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TNFAIP1Q13829 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TNFAIP1Q13829 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TNFAIP1Q13829 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TNFAIP1Q13829 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TNFAIP1Q13829 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TNFAIP1Q13829 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TNFAIP1Q13829 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TNFAIP1Q13829 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TNFAIP1Q13829 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TNFAIP1Q13829 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TNFAIP1Q13829 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
TNFAIP1Q13829 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TNFAIP1Q13829 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TNFAIP1Q13829 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TNFAIP1Q13829 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TNFAIP1Q13829 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TNFAIP1Q13829 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
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