Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ALCAMQ13740 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
ALCAMQ13740 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALCAMQ13740 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALCAMQ13740 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ALCAMQ13740 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
ALCAMQ13740 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ALCAMQ13740 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
ALCAMQ13740 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.3□□□□□ -2.78
ALCAMQ13740 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ALCAMQ13740 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
ALCAMQ13740 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
ALCAMQ13740 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ALCAMQ13740 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ALCAMQ13740 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ALCAMQ13740 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ALCAMQ13740 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ALCAMQ13740 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ALCAMQ13740 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ALCAMQ13740 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ALCAMQ13740 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ALCAMQ13740 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ALCAMQ13740 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ALCAMQ13740 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ALCAMQ13740 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ALCAMQ13740 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ALCAMQ13740 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ALCAMQ13740 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ALCAMQ13740 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ALCAMQ13740 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ALCAMQ13740 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ALCAMQ13740 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
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