Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PRPF4BQ13523 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRPF4BQ13523 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRPF4BQ13523 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRPF4BQ13523 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PRPF4BQ13523 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRPF4BQ13523 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRPF4BQ13523 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRPF4BQ13523 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PRPF4BQ13523 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PRPF4BQ13523 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PRPF4BQ13523 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PRPF4BQ13523 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PRPF4BQ13523 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PRPF4BQ13523 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PRPF4BQ13523 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
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