Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRZ1P23471 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRZ1P23471 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPRZ1P23471 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRZ1P23471 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms