Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TMEM260Q9NX78 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TMEM260Q9NX78 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMEM260Q9NX78 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TMEM260Q9NX78 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TMEM260Q9NX78 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TMEM260Q9NX78 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TMEM260Q9NX78 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TMEM260Q9NX78 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMEM260Q9NX78 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMEM260Q9NX78 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMEM260Q9NX78 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMEM260Q9NX78 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TMEM260Q9NX78 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMEM260Q9NX78 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMEM260Q9NX78 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMEM260Q9NX78 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TMEM260Q9NX78 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TMEM260Q9NX78 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.8 ms