Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
MEIS3Q99687 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
MEIS3Q99687 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
MEIS3Q99687 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
MEIS3Q99687 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.1 ms