Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
KNOP1Q1ED39 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
KNOP1Q1ED39 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
KNOP1Q1ED39 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
KNOP1Q1ED39 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
KNOP1Q1ED39 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
KNOP1Q1ED39 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
KNOP1Q1ED39 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
KNOP1Q1ED39 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
KNOP1Q1ED39 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
KNOP1Q1ED39 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
KNOP1Q1ED39 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
KNOP1Q1ED39 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
KNOP1Q1ED39 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
KNOP1Q1ED39 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
KNOP1Q1ED39 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
KNOP1Q1ED39 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
KNOP1Q1ED39 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
KNOP1Q1ED39 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
KNOP1Q1ED39 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
KNOP1Q1ED39 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
KNOP1Q1ED39 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
KNOP1Q1ED39 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
KNOP1Q1ED39 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
KNOP1Q1ED39 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
KNOP1Q1ED39 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
KNOP1Q1ED39 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
KNOP1Q1ED39 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
KNOP1Q1ED39 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
KNOP1Q1ED39 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
KNOP1Q1ED39 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
KNOP1Q1ED39 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
KNOP1Q1ED39 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
KNOP1Q1ED39 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KNOP1Q1ED39 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KNOP1Q1ED39 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KNOP1Q1ED39 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
KNOP1Q1ED39 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
KNOP1Q1ED39 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
KNOP1Q1ED39 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
KNOP1Q1ED39 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221 ms