Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ME3Q16798 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ME3Q16798 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ME3Q16798 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ME3Q16798 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ME3Q16798 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ME3Q16798 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ME3Q16798 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ME3Q16798 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ME3Q16798 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ME3Q16798 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ME3Q16798 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ME3Q16798 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ME3Q16798 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ME3Q16798 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ME3Q16798 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ME3Q16798 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ME3Q16798 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ME3Q16798 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ME3Q16798 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ME3Q16798 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ME3Q16798 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ME3Q16798 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ME3Q16798 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ME3Q16798 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ME3Q16798 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ME3Q16798 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ME3Q16798 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ME3Q16798 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ME3Q16798 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ME3Q16798 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ME3Q16798 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ME3Q16798 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ME3Q16798 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ME3Q16798 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ME3Q16798 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ME3Q16798 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ME3Q16798 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ME3Q16798 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ME3Q16798 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ME3Q16798 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ME3Q16798 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ME3Q16798 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ME3Q16798 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ME3Q16798 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ME3Q16798 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ME3Q16798 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ME3Q16798 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ME3Q16798 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ME3Q16798 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ME3Q16798 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ME3Q16798 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ME3Q16798 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ME3Q16798 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ME3Q16798 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ME3Q16798 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ME3Q16798 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ME3Q16798 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ME3Q16798 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ME3Q16798 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ME3Q16798 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ME3Q16798 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ME3Q16798 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ME3Q16798 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ME3Q16798 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ME3Q16798 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ME3Q16798 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ME3Q16798 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ME3Q16798 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ME3Q16798 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ME3Q16798 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ME3Q16798 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ME3Q16798 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ME3Q16798 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ME3Q16798 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ME3Q16798 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ME3Q16798 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ME3Q16798 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ME3Q16798 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ME3Q16798 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ME3Q16798 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ME3Q16798 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ME3Q16798 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ME3Q16798 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ME3Q16798 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ME3Q16798 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ME3Q16798 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ME3Q16798 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ME3Q16798 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ME3Q16798 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ME3Q16798 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ME3Q16798 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ME3Q16798 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ME3Q16798 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ME3Q16798 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ME3Q16798 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ME3Q16798 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ME3Q16798 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ME3Q16798 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ME3Q16798 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.7 ms