Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NCAPHQ15003 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NCAPHQ15003 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NCAPHQ15003 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NCAPHQ15003 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NCAPHQ15003 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NCAPHQ15003 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NCAPHQ15003 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NCAPHQ15003 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NCAPHQ15003 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NCAPHQ15003 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCAPHQ15003 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NCAPHQ15003 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NCAPHQ15003 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NCAPHQ15003 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NCAPHQ15003 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NCAPHQ15003 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NCAPHQ15003 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NCAPHQ15003 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NCAPHQ15003 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NCAPHQ15003 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NCAPHQ15003 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NCAPHQ15003 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NCAPHQ15003 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NCAPHQ15003 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NCAPHQ15003 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NCAPHQ15003 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
NCAPHQ15003 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NCAPHQ15003 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NCAPHQ15003 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NCAPHQ15003 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.7 ms