Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ODF1Q14990 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ODF1Q14990 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ODF1Q14990 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ODF1Q14990 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ODF1Q14990 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ODF1Q14990 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ODF1Q14990 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ODF1Q14990 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ODF1Q14990 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ODF1Q14990 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ODF1Q14990 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ODF1Q14990 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ODF1Q14990 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
ODF1Q14990 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ODF1Q14990 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ODF1Q14990 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ODF1Q14990 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ODF1Q14990 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ODF1Q14990 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ODF1Q14990 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ODF1Q14990 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ODF1Q14990 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ODF1Q14990 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ODF1Q14990 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
ODF1Q14990 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ODF1Q14990 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ODF1Q14990 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
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