Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GTF2H2Q13888 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GTF2H2Q13888 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GTF2H2Q13888 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GTF2H2Q13888 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GTF2H2Q13888 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GTF2H2Q13888 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
GTF2H2Q13888 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
GTF2H2Q13888 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
GTF2H2Q13888 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
GTF2H2Q13888 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
GTF2H2Q13888 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
GTF2H2Q13888 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GTF2H2Q13888 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GTF2H2Q13888 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GTF2H2Q13888 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GTF2H2Q13888 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
GTF2H2Q13888 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
GTF2H2Q13888 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GTF2H2Q13888 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GTF2H2Q13888 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GTF2H2Q13888 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GTF2H2Q13888 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GTF2H2Q13888 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GTF2H2Q13888 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GTF2H2Q13888 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GTF2H2Q13888 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GTF2H2Q13888 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
GTF2H2Q13888 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
GTF2H2Q13888 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GTF2H2Q13888 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 921.9 ms