Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.78□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
RIPK1Q13546 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RIPK1Q13546 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RIPK1Q13546 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms