Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, human

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene	UniProt Accession	Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1	P21675	RNU6-732P-201	ENST00000516033	103 nt	BASIC	-1.03	□□□□□ -2.57
TAF1	P21675	MIR4499-201	ENST00000584834	69 nt	BASIC	-1.03	□□□□□ -2.57
TAF1	P21675	MIR6818-201	ENST00000621576	65 nt	BASIC	-1.04	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	MIR3170-201	ENST00000582699	77 nt	BASIC	-1.05	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	RNU6-520P-201	ENST00000384717	104 nt	BASIC	-1.05	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	AC114801.3-201	ENST00000510231	177 nt	BASIC	-1.05	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	RNA5SP461-201	ENST00000516451	104 nt	BASIC	-1.05	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	MIR7978-201	ENST00000636158	59 nt	BASIC	-1.05	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	MIR147A-201	ENST00000385079	72 nt	BASIC	-1.06	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	MIR587-201	ENST00000384845	96 nt	BASIC	-1.07	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	MIR3115-201	ENST00000577915	68 nt	BASIC	-1.07	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	RNU6-576P-201	ENST00000390854	102 nt	BASIC	-1.08	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	SNORD116.2-201	ENST00000391251	93 nt	BASIC	-1.08	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	RNU7-119P-201	ENST00000459279	63 nt	BASIC	-1.08	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	MIR29B1-201	ENST00000385015	81 nt	BASIC	-1.09	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	RNU6-995P-201	ENST00000391244	107 nt	BASIC	-1.09	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	Y_RNA.109-201	ENST00000363215	102 nt	BASIC	-1.09	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	RNU6-669P-201	ENST00000365575	107 nt	BASIC	-1.09	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	U6.111-201	ENST00000636093	83 nt	BASIC	-1.09	□□□□□ -2.58
TAF1	P21675	SNORD114-3-201	ENST00000364969	75 nt	BASIC	-1.1	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	AC138207.3-201	ENST00000585289	166 nt	BASIC	-1.1	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	Y_RNA.386-201	ENST00000383913	105 nt	BASIC	-1.11	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	RNU6-1157P-201	ENST00000384456	106 nt	BASIC	-1.11	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	SNORA40B-201	ENST00000385573	128 nt	BASIC	-1.11	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	RNU6-1111P-201	ENST00000391118	107 nt	BASIC	-1.11	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	RNU6-172P-201	ENST00000411000	93 nt	BASIC	-1.11	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	MIR4770-201	ENST00000579149	58 nt	BASIC	-1.11	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	Y_RNA.139-201	ENST00000363464	102 nt	BASIC	-1.12	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	Y_RNA.321-201	ENST00000365149	102 nt	BASIC	-1.12	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	Y_RNA.365-201	ENST00000365537	102 nt	BASIC	-1.12	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	MIR579-201	ENST00000385221	98 nt	BASIC	-1.12	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	RNU6-1267P-201	ENST00000410747	107 nt	BASIC	-1.12	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	RNU6-598P-201	ENST00000364017	105 nt	BASIC	-1.12	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	RNU6-800P-201	ENST00000384473	103 nt	BASIC	-1.12	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	AL500527.2-201	ENST00000454105	95 nt	BASIC	-1.12	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	MIR7110-201	ENST00000612638	86 nt	BASIC	-1.13	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	RNU6-810P-201	ENST00000364001	107 nt	BASIC	-1.14	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	MIR23C-201	ENST00000579846	100 nt	BASIC	-1.14	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	MIR4320-201	ENST00000636981	65 nt	BASIC	-1.14	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	SPRY4-IT1_2.1-201	ENST00000612613	121 nt	BASIC	-1.15	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	MIR5591-201	ENST00000578248	65 nt	BASIC	-1.16	□□□□□ -2.59
TAF1	P21675	RNU7-160P-201	ENST00000516660	62 nt	BASIC	-1.17	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	RNU6-164P-201	ENST00000364604	103 nt	BASIC	-1.18	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	AC090616.4-201	ENST00000448026	115 nt	BASIC	-1.18	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	uc_338.19-201	ENST00000616808	99 nt	BASIC	-1.18	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	Y_RNA.340-201	ENST00000365330	92 nt	BASIC	-1.18	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	Y_RNA.442-201	ENST00000384131	102 nt	BASIC	-1.18	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	HLA-S-202	ENST00000425174	53 nt	BASIC	-1.18	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	AC120024.2-201	ENST00000576526	175 nt	BASIC	-1.19	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	RNU6-608P-201	ENST00000383927	104 nt	BASIC	-1.2	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	RNA5SP26-201	ENST00000362406	119 nt	BASIC	-1.2	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	SNORA27.2-201	ENST00000363365	126 nt	BASIC	-1.2	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	SNORD45.2-201	ENST00000363552	72 nt	BASIC	-1.2	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	MIR1285-2-201	ENST00000408311	88 nt	BASIC	-1.2	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	MIR520D-201	ENST00000385002	87 nt	BASIC	-1.21	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	Y_RNA.603-201	ENST00000410571	108 nt	BASIC	-1.21	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	RNU7-134P-201	ENST00000458997	64 nt	BASIC	-1.21	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	Y_RNA.468-201	ENST00000384298	102 nt	BASIC	-1.22	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	RNU6-231P-201	ENST00000517122	103 nt	BASIC	-1.22	□□□□□ -2.6
TAF1	P21675	MIR365A-201	ENST00000362260	87 nt	BASIC	-1.22	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	SNORA40.16-201	ENST00000517238	121 nt	BASIC	-1.22	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	MTRNR2L9-201	ENST00000622562	75 nt	BASIC	-1.22	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	Y_RNA.181-201	ENST00000363872	101 nt	BASIC	-1.23	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	RPL35AP4-201	ENST00000412007	102 nt	BASIC	-1.23	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	SNORD60-201	ENST00000383903	83 nt	BASIC	-1.24	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	RNU6-974P-201	ENST00000384099	108 nt	BASIC	-1.24	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	AC125388.1-201	ENST00000459631	156 nt	BASIC	-1.24	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	SNORD63.2-201	ENST00000516303	64 nt	BASIC	-1.24	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	Y_RNA.413-201	ENST00000384007	102 nt	BASIC	-1.24	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	Y_RNA.754-201	ENST00000476024	102 nt	BASIC	-1.24	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	RNU6-638P-201	ENST00000516582	104 nt	BASIC	-1.24	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	Y_RNA.790-201	ENST00000614282	102 nt	BASIC	-1.24	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	Y_RNA.782-201	ENST00000614695	102 nt	BASIC	-1.24	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	MIR125B1-201	ENST00000385236	88 nt	BASIC	-1.25	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	RNU6-79P-201	ENST00000362511	107 nt	BASIC	-1.26	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	MIR466-201	ENST00000580653	84 nt	BASIC	-1.26	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	RNU6-1206P-201	ENST00000516339	103 nt	BASIC	-1.26	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	Y_RNA.699-201	ENST00000516803	93 nt	BASIC	-1.26	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	MIR1246-201	ENST00000636535	73 nt	BASIC	-1.26	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	AC139453.2-201	ENST00000487255	133 nt	BASIC	-1.27	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	RNU6-122P-201	ENST00000516818	107 nt	BASIC	-1.27	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	MIR548X-201	ENST00000580069	75 nt	BASIC	-1.27	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	MIR8485-201	ENST00000401372	91 nt	BASIC	-1.28	□□□□□ -2.61
TAF1	P21675	MIR4441-201	ENST00000582623	100 nt	BASIC	-1.29	□□□□□ -2.62
TAF1	P21675	MIR1207-201	ENST00000408249	87 nt	BASIC	-1.31	□□□□□ -2.62
TAF1	P21675	RNU6-828P-201	ENST00000364876	107 nt	BASIC	-1.31	□□□□□ -2.62
TAF1	P21675	hsa-mir-3607.1-201	ENST00000637229	79 nt	BASIC	-1.31	□□□□□ -2.62
TAF1	P21675	RNU6-419P-201	ENST00000517030	63 nt	BASIC	-1.32	□□□□□ -2.62
TAF1	P21675	RNU6-695P-201	ENST00000391157	104 nt	BASIC	-1.33	□□□□□ -2.62
TAF1	P21675	RNU6-226P-201	ENST00000363778	107 nt	BASIC	-1.33	□□□□□ -2.62
TAF1	P21675	ST7-OT3_1.1-201	ENST00000619607	74 nt	BASIC	-1.34	□□□□□ -2.62
TAF1	P21675	RNU6-1079P-201	ENST00000362861	110 nt	BASIC	-1.35	□□□□□ -2.63
TAF1	P21675	TRAJ42-201	ENST00000390495	66 nt	APPRIS P1 BASIC	-1.35	□□□□□ -2.63
TAF1	P21675	Y_RNA.781-201	ENST00000620301	103 nt	BASIC	-1.35	□□□□□ -2.63
TAF1	P21675	Y_RNA.616-201	ENST00000410835	95 nt	BASIC	-1.37	□□□□□ -2.63
TAF1	P21675	RNU6-361P-201	ENST00000364454	107 nt	BASIC	-1.37	□□□□□ -2.63
TAF1	P21675	AC091912.2-201	ENST00000624798	167 nt	BASIC	-1.37	□□□□□ -2.63
TAF1	P21675	MIR4520-1-201	ENST00000582609	70 nt	BASIC	-1.38	□□□□□ -2.63
TAF1	P21675	RNY3P8-201	ENST00000411366	126 nt	BASIC	-1.39	□□□□□ -2.63
TAF1	P21675	U4.2-201	ENST00000618561	85 nt	BASIC	-1.39	□□□□□ -2.63

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