Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.2
POLR1AO95602 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.2
POLR1AO95602 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
POLR1AO95602 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
POLR1AO95602 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
POLR1AO95602 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-4.98□□□□□ -3.21
POLR1AO95602 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
POLR1AO95602 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
POLR1AO95602 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
POLR1AO95602 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
POLR1AO95602 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
POLR1AO95602 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
POLR1AO95602 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
POLR1AO95602 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
POLR1AO95602 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
POLR1AO95602 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
POLR1AO95602 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
POLR1AO95602 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
POLR1AO95602 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
POLR1AO95602 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
POLR1AO95602 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
POLR1AO95602 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
POLR1AO95602 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
POLR1AO95602 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
POLR1AO95602 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
POLR1AO95602 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
POLR1AO95602 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
POLR1AO95602 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.24
POLR1AO95602 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-5.24□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
POLR1AO95602 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
POLR1AO95602 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
POLR1AO95602 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
POLR1AO95602 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
POLR1AO95602 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
POLR1AO95602 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
POLR1AO95602 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
POLR1AO95602 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
POLR1AO95602 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
POLR1AO95602 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-5.36□□□□□ -3.27
POLR1AO95602 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
POLR1AO95602 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-5.39□□□□□ -3.27
POLR1AO95602 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-5.39□□□□□ -3.27
POLR1AO95602 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
POLR1AO95602 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
POLR1AO95602 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
POLR1AO95602 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
POLR1AO95602 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
POLR1AO95602 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
POLR1AO95602 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
POLR1AO95602 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
POLR1AO95602 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
POLR1AO95602 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
POLR1AO95602 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
POLR1AO95602 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.3 ms