Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SNX13Q9Y5W8 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SNX13Q9Y5W8 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNX13Q9Y5W8 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SNX13Q9Y5W8 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SNX13Q9Y5W8 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNX13Q9Y5W8 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNX13Q9Y5W8 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNX13Q9Y5W8 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNX13Q9Y5W8 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNX13Q9Y5W8 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNX13Q9Y5W8 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNX13Q9Y5W8 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNX13Q9Y5W8 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNX13Q9Y5W8 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNX13Q9Y5W8 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNX13Q9Y5W8 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNX13Q9Y5W8 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNX13Q9Y5W8 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNX13Q9Y5W8 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNX13Q9Y5W8 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
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SNX13Q9Y5W8 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
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SNX13Q9Y5W8 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
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SNX13Q9Y5W8 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
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SNX13Q9Y5W8 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SNX13Q9Y5W8 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNX13Q9Y5W8 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNX13Q9Y5W8 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
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SNX13Q9Y5W8 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
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SNX13Q9Y5W8 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNX13Q9Y5W8 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNX13Q9Y5W8 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNX13Q9Y5W8 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
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